کتاب« بیوانفورماتیک گیاهی(روش¬ها و قراردادها) یک اثر ترجمه ای است که به همت دکتر رودابه راوش عضو هیئت علمی دانشگاه شهرکرد، دکتر زهرا زینتی عضو هیئت علمی دانشگاه داراب و دکتر الهام اشرفی دهکردی منتشر شده است.  این کتاب در هیجده فصل شامل: استفاده از GenBank، UniProtKB/Swiss-Prot دستورالعمل تفسیر شده ی UniProt دانش محور: نحوه ی استفاده از نمای ورودی، منابع بیوانفورماتیک KEGG برای ژنوم و سوخت و ساز گیاهی، پایگاه داده ی مسیر گیاهی، آنتولوژی گیاهی: ابزاری برای ژنومیک گیاهی، انسمبل گیاهان: ابزارهای ادغام برای به تصویر کشیدن، استخراج و تجزیه و تحلیل داده های ژنوم گیاهی، کرامینه: منبعی برای تجزیه و تحلیل مقایسه ای مسیرها و ژنوم های گیاهی، منابع اطلاعاتی ژنوم گیاهی pGSB/MIPS و مفاهیم برای تجزیه و تحلیل ژنوم گراس های پیچیده، MaizeGDB پایگاه ژنتیک و ژنومی ذرت، WheatGenome.info منبعی برای منبع ژنومیکس گندم، راهنمای کاربردی پایگاه داده ی براسیکا: براد BRAD، شناسایی توالی TAG نواحی ژنومی با استفاده از TAGdb، هم¬ردیفی خوانش کوتاه با استفاده از SOAp2، تبلت: نمایش اسمبلی ها و نقشه یابی های مربوط به توالی یابی نسل بعدی، تجزیه و تحلیل داده های ژنوتایپینگ با تعیین توالی(GBS)، تعیین ژنوتیپ با تعیین توالی سطح- محور با استفاده از یک جمعیت هاپلوئیدی برای فراخوانی SNP، استنباط وارونگی ژن و بهبود اسمبلی های ژنومی، یافتن و تعیین ویژگی های تکرارها در ژنوم های گیاهی، تجزیه و تحلیل داده هایRNA-seq  با استفاده از TOPHat و Cufflinks در  460 صفحه در قطع وزیری ، ترجمه و به همت انتشارات جهاد دانشگاهی استان وارد بازار نشر شده است. امروزه دانش بیوانفورماتیک جایگاه ویژهای در رشته های مختلف بیولوژی و کشاورزی دارد و کاربرد بیوانفورماتیک در پژوهش های کشاورزی در حال افزایش است. از این رو، آشنایی با روش ها و نحوه تفسیر و کاربرد نتایج آن ها از اهمیت خاصی برخوردار است. یادآور می شود هم اکنون کتاب های بیوانفورماتیک بسیاری در دسترس هستند اما فقدان کتاب تخصصی بیوانفورماتیک گیاهی به زبان فارسی، احساس می شد. بنابراین، در این کتاب سعی شده است روش ها و قراردادهای بیوانفورماتیک با تاکید بر گیاهان ارائه می شود. این کتاب می تواند به عنوان کتاب مرجع برای دانشجویان کارشناسی، کارشناسی ارشد و دکتری بسیار مفید باشد.

در هیجده فصل شامل: استفاده از GenBank، UniProtKB/Swiss-Prot دستورالعمل تفسیر شده ی UniProt دانش محور: نحوه ی استفاده از نمای ورودی، منابع بیوانفورماتیک KEGG برای ژنوم و سوخت و ساز گیاهی، پایگاه داده ی مسیر گیاهی، آنتولوژی گیاهی: ابزاری برای ژنومیک گیاهی، انسمبل گیاهان: ابزارهای ادغام برای به تصویر کشیدن، استخراج و تجزیه و تحلیل داده های ژنوم گیاهی، کرامینه: منبعی برای تجزیه و تحلیل مقایسه ای مسیرها و ژنوم های گیاهی، منابع اطلاعاتی ژنوم گیاهی pGSB/MIPS و مفاهیم برای تجزیه و تحلیل ژنوم گراس های پیچیده، MaizeGDB پایگاه ژنتیک و ژنومی ذرت، WheatGenome.info منبعی برای منبع ژنومیکس گندم، راهنمای کاربردی پایگاه داده ی براسیکا: براد BRAD، شناسایی توالی TAG نواحی ژنومی با استفاده از TAGdb، هم¬ردیفی خوانش کوتاه با استفاده از SOAp2، تبلت: نمایش اسمبلی ها و نقشه یابی های مربوط به توالی یابی نسل بعدی، تجزیه و تحلیل داده های ژنوتایپینگ با تعیین توالی(GBS)، تعیین ژنوتیپ با تعیین توالی سطح- محور با استفاده از یک جمعیت هاپلوئیدی برای فراخوانی SNP، استنباط وارونگی ژن و بهبود اسمبلی های ژنومی، یافتن و تعیین ویژگی های تکرارها در ژنوم های گیاهی، تجزیه و تحلیل داده هایRNA-seq  با استفاده از TOPHat و Cufflinks .