کتاب حاضر این امکان را برای محققین فراهم می آورد که تفاوت بیان در سطوح ژن، اگزون و رونوشت را مورد بررسی قرار داده و ژن ها، رونوشت ها و ترانسکریپتوم های جدید را شناسایی کنند. با توجه به اهمیت نقش تنظیمی RNA های نارمزگر کوچک، بخش هایی از این کتاب به طور کامل به شناساییی و آنالیز عملکردی آنها اختصاص داده شده است.

فصل اول : مقدمه ای بر توالی یابی RNA

فصل دوم : مقدمه ای بر آنالیز داده های توالی یابی RNA

فصل سوم : کنترل کیفیت و پیش پردازش

فصل چهارم : همردیف سازی خوانش ها با مرجع

فصل پنجم: اسمبل کردن ترانسکریپتوم

فصل ششم: کمی سازی و کنترل کیفیت مبتنی بر حاشیه نگاری

فصل هفتم : چارچوب آنالیز توالی یابی RNA در  R و  Bioconduictor

فصل هشتم : آنالیز افتراقی بیان

فصل نهم :آنالیز افتراقی استفاده از اگزون

فصل دهم : حاشیه نگاری نتایج

................