کتاب روش‌های مولکولی در زیست شناسی گیاهی که ترجمه ای از کتاب ارزشمند «Molecular Methods in Plant Biology» می باشد، به اهتمام و نظارت عضو هیات علمی پژوهشکده گیاهان دارویی جهاددانشگاهی و با همکاری محققان دانشگاهی منتشر شد.

معرفی و مقدمه -  ۹

روش‌های مولکولی در زیست‌شناسی گیاهی- ۱۰

چکیدهای بر واحدهای متریک Metric Units -۱۱

نمودار جریان پروتک لها - توالی DNA  بافت‌های گیاهی - ۱۱

بخش ۲

استخراج DNA  ژنومی گیاهان- ۱۳

ملاحظات عمومی و اصول - ۱۴

استخراج DNA ژنومی گیاه با استفاده از CTAB: روش آماده سازی کوتاه (Mini Prep) -۱۶  

استخراج DNA ژنومی با استفاده از CTAB  است: در مقیاس بزرگ -۱۸

استخراج DNA ژنومی  (Mini Prep) برای گیاهان با کربوهیدرات بالا -۲۱

خالص سازی سزیم کلرید از DNA  ژنومی -۲۳

خالص سازی PEG  از DNA ژنومی -۲۵

روش تمیز کردن اسپین  )چرخش(  ژل DNA  ژنومی -۲۷

استخراج DNA اقاقیا: روش Miniprep  - ۲۹

آماده‌سازی DNA گیاهی ( Miniprep): روشی کوتاه برای نمونه‌های خشک -۳۱

بخش ۳

استخراج RNA گیاهی - ۳۳

ملاحظه عمومی و توضیح اصول -۳۴

استخراج RNA با استفاده از بافر بورات داغ - ۳۵

روش جداسازی TRIzol RNA -۳۸

استخراج ساده RNA گیاهی -۴۱

بخش ۴

غلظت اسید نوکلئیک Fluorometry -۴۳

بخش ۵

الکتروفورز ژل آگارز  -۴۵

آماده سازی مینی ژل‌ها )ژل‌های کوچک) -۴۶

آماده سازی نمونه‌ها و جاری شدن ژل‌های کوچک -۴۷

رنگ آمیزی و تصویربرداری مینی ژل‌ها -۴۸

غیرفعال کردن اتیدیوم بروماید -۵۰

بخش ۶

واکنش زنجیره‌ای پلیمراز

چگونگی انجام PCR - ۵۲

تقویت یا افزایش تقارن -۵۳

تکثیر عادی ژن‌ها -۵۶

بخش ۷

تخلیص محصولات PCR برای استفاده در واکنش‌های تعیین توالی - ۶۷

خالص سازی ستون با استفاده از چرخه EZNA - کیت خالص -۶۸

ژل خالص محصولات PCR  با استفاده از کیت استخراج ژل Qiaquick- ۶۹

پروتکل غشاءDEAE Nylon - ۷۰

هدایت مستقیم رسوب محصولات PCR  با استفاده از PEG -۷۲

بخش  ۸

شبیه سازی TA (cloning) و تعیین توالی محصولات PCR  -۷۳

معرفی -۷۴

 انعقاد و شبیه‌سازی محصولات PCR - ۷۷

تغییر شکل سلول‌های مناسب: روش شیمیایی  )شوک حرارتی) – ۷۸

آماده‌سازی کوچک (Mini-prep) پلازمید: روش ستون EZNA -۷۹

آماده‌سازی کوچک  (Mini-prep) و درج تاییدیه پلازمید: روش Alkaline Lysis - ۸۱

جلوگیری تجزیه پلازمید DNA - ۸۲

کلنی PCR: پیشنهاد آماده‌سازی کوچک (Mini-prep) -۸۲

بخش ۹

واکنش‌های تعیین توالی DNA  - ۸۵

چگونگی واکنش‌های تعیین توالی -۸۶

چرخه تعیین توالی -۸۸

خالص کردن محصولات چرخه تعیین توالی با استفاده از ستونهای سفادکس CENTRI SEP/ -۸۹

تصفیه چرخه توالی محصولات از طریق بارش اتانول - ۹۰

بخش ۱۰

تعیین توالی خودکار  DNA ABI ۳۳۷ - ۹۳

قبل از جاری شدن ژل - ۹۴

تمیز کردن و نصب و را هاندازی صفحات و ریختن ژل -۹۵

کارهایی که باید در حین پلیمرازسیون ژل انجام دهیم - ۹۸

بارگیری ژل و جاری شدن - ۱۰۱

بعد از جاری شدن - ۱۰۳

اصلاح و پیرایش پروتکل در هنگام استفاده از "شانه‌های غشاء" - ۱۰۴   

صدور داده ها به کامپیوترهای دیگر - ۱۰۶

ویرایش اطلاعات تعیین توالی - ۱۰۷

تفسیر داده های توالی- ۱۰۷

بخش ۱۱

محدودیت گوارش و ساترن بلات Southern Blotting -۱۰۹

محدودیت گوارش DNA گیاهی - ۱۱۰

الکتروفورز ژل آگارز به وسیله محدودیت گوارش و هضم -۱۱۰

ساترن بلات Southern Blotting - روش انتقال مرطوب -۱۱۱

بخش ۱۲

 هیبریداسیون غیر رادیواکتیو -۱۱۳

ساخت کاوشگر با استفاده از دی اکسیژنین در تقویت PCR -۱۱۴

هیبریداسیون با کاوشگر نشان دار دیگوکسیژنین -۱۱۵

تشخیص Chemiluminescent از Digoxigenin- نشاندار کردن کاوشگر هیبریداسیون -۱۱۷

بخش  ۱۳

دستورالعمل محلول -۱۱۹

بخش  ۱۴

اطلاعات تکمیلی  -۱۳۱

بخش  ۱۵

منابع  -۱۴۷