کتاب حاظر متشکل از 7 فصل که به اجمال شامل مقدمه و آشنایی با داکینگ مولکولی، معرفی نرم‌افزارهای مهم و استفاده از آنها، بررسی ساختار پروتئین، بررسی نتایج آنالیز داکینگ و در نهایت آینده هوش مصنوعی و بیوانفورماتیک است. در این کتاب سعی شده است تا مهمترین سرورها و نرم‌افزارها و نحوه انجام کار با آنها به علاقمندان آموزش داده شود. بنابراین استفاده از این کتاب می‌تواند مقدمه‌ای بر طراحی یک مسیر درست علمی و پژوهشی شود زیرا آینده از آن نرم‌افزارها و علم بیوانفورماتیک است.

فصل اول

مقدمه و تعاریف

فصل دوم

اصول طراحی پروژه

فصل سوم

آماده سازی مولکول کوچک زیستی

فصل چهارم

آماده سازی گیرنده

فصل پنجم

داکینگ مولکولی

فصل ششم

آنالیز نتایج داکینگ مولکولی

فصل هفتم

بیوانفورماتیک و هوش مصنوعی