تلاش‌‌هایی جهت بررسی ترکیب میکروبیوم روده بسیاری از آبزیان مهم تجاری نیز انجام شده است. تنوع میکروبیوم را می‌‌توان با مسائل بهداشتی مانند شدت هضم غذا در دستگاه گوارش، تولید انرژی و متابولیسم، تغذیه، رشد و تولیدمثل و مسائل مربوط به بیماری‌‌های عفونی و سیستم ایمنی بدن در ارتباط دانست. همچنین پیشنهاد شده است که میکروبیوم روده می‌‌تواند به‌‌عنوان نشانگر زیستی سلامت ماهی مورد استفاده قرار گیرد. توسعه روش‌‌های مولکولی، بسیاری از پژوهشگران را به انجام مطالعات بر روی جنبه‌های مختلف عملکردی میکروب‌ها تشویق کرد و در سال‌های اخیر زمینه متاژنومیکس میکروبیوم اهمیت زیادی پیدا کرده است.در این کتاب سعی شده است ضمن بررسی عوامل مؤثر بر رشد و نمو دستگاه گوارش طیور، شکل‌‌گیری، عوامل دخیل در توسعه و نقش و عملکرد حیاتی میکروبیوتای دستگاه گوارش همراه با محصولات تولیدی و سازو کارهای عمل آنها در جوجه‌‌های گوشتی و مرغان تخمگذار و متعاقباً آبزیان پرورشی مورد بررسی قرار گیرد.

  فصل اول: رشد و نمو دستگاه گوارش طیور / 13 

 فصل دوم: میکروبیوتا دستگاه گوارش / 39

فصل سوم: رده بندی باکتری های روده / 71

فصل چهارم: تعدیل میکروبیوتای  GIT / 81

فصل پنجم: محصولات تخمیر میکروبی میکروبیوتا / 125

فصل ششم: فیبر غذایی و تعادل میکروبیوم / 135

فصل هفتم: میکروبیوتا، سلامت روده وبهره وری جوجه های گوشتی / 151

فصل هشتم: میکروبیوتای روده مرغان تخمگذار و کیفیت و ایمنی تخم مرغ / 161

فصل نهم: ایمنی تغذیه و توسعه میکروبیوتای روده / 175

فصل دهم: مدیریت میکروبیوتای روده جوجه از طریق تغذیه درون تخم مرغی  / 185

فصل یازدهم: استفاده بالقوه از ترکیب میکروبیوتای روده به عنوان نشانگر زیستی استرس گرمایی  / 199

فصل دوازدهم: تاثیر آنتی بیوتتیک درمانی بر پویایی ژن های مقاومت و ترکیب میکروبیوتای روده / 211 

فصل سیزدهم: مروری بر میکروبیوتا در آبزیان / 217