مدیریت زیست بومی شیوه­ای از مدیریت برای حفاظت منابع طبیعی و پایدار­سازی خدمات زیست ­بومی است که هم‌زمان به ارزش­ها و نیازهای اقتصادی اجتماعی و الزامات فرهنگی و سیاسی جوامع ذیربط توجه داشته و برخورداری نسل حاضر و نسل­های آینده از منافع زیست بوم را مد نظر دارد. این شیوه مدیریت مبتنی بر باور به ارتباط نزدیک و غیر قابل تفکیک خدمات زیست بوم و رفاه و سلامت جوامع انسانی است و هدف آن حصول اطمینان از استقرار نظامی است که از تداوم خدمات زیست­بوم پشتیبانی کرده و از آن حفاظت می­کند.