پیشگفتار
میکروارگانیسمها بهویژه باکتریها در اکوسیستمهای مختلفی زیست مینمایند و حتی در مکانهایی که امکان حیات برای سایر موجودات وجود ندارد، آنها در آنجا وجود داشته و نقشآفرینی مینمایند. با توجه به فقدان یک منبع جامع فارسی در زمینه اکولوژی میکروبی که بتواند نیاز دانشجویان رشتههای زیست شناسی بهویژه میکروب شناسی و حتی رشتههای علوم کشاورزی و محیط زیست را در این زمینه برآورده نماید، اینجانب با مطالعه و جستجوی فراوان درنهایت با این کتاب جامع آشنا شدم که برای اولین بار در سال ۲۰۱۱ تالیف شده بود و بهنظر اینجانب میتوان این کتاب را در حال حاضر به لحاظ تنوع محتوا، بهعنوان جامعترین کتاب اکولوژی میکروبی فارسی یا ترجمه شده در کشور معرفی نمود. دلیل انتخاب این کتاب برای ترجمه نسبت به کتابهای مشابه موجود، آن بود که محتویات آن علاوه بر معرفی کلیات زیست شناسی در زمینه پیدایش حیات و تشکیل سلول، پیدایش حیات میکروبی، تنوع میکروارگانیسمها، سیستماتیک و فیزیولوژی باکتریها، تنوع زیستگاههای میکروبی و نقش میکروارگانیسمها در زیستگاههای مختلف، روشهای مطالعه اکولوژی میکروبی و همچنین انواع برهمکنشهایی که خود میکروبها با هم و با موجوداتی نظیر گیاهان و جانوران دارند، در آن تقریباً به تفصیل بحث شده است. درنهایت این کتاب بهطور جامع به نقش بیبدیل میکروارگانیسمها در فرآیندهای مهمی نظیر چرخههای زیست ژئوشیمایی عناصر، معنی شدن زیستی، تجزیه ترکیبات طبیعی و زیستپالایی اشاره مینماید که امروزه از مورد اخیر بهطور عملی در محیطهای مختلف آلوده به آلایندهها استفاده میشود.
امید است تا این کتاب بتواند به بسیاری از سوالات شما در زمینه وجود و نقش میکروارگانیسمها در اکوسیستمهای مختلف پاسخ دهد و نیاز دانشجویان گرایشهای مختلف رشته زیستشناسی از آنجمله میکروبشناسی، گیاهشناسی، علوم جانوری، ژنتیک، بیوشیمی، زیستشناسی دریا و همچنین رشتههای مختلف کشاورزی نظیر علوم خاک، زراعت، گیاهپزشکی، علوم دامی، باغبانی و محیط زیست را مرتفع سازد.
برخود لازم میدانم که از دانشگاه گیلان که زمینه و بستر مطالعه و ترجمه این کتاب را برای اینجانب فراهم نموده و همچنین از معاونت پژوهشی و انتشارات پژوهشکده محیط زیست جهاد دانشگاه گیلان بخاطر زحمت چاپ و انتشار این کتاب تشکر و قدردانی نمایم. در پایان اینجانب از راهنماییهای ارزنده شما مخاطبین گرامی جهت اعمال در اصلاحات احتمالی چاپهای بعدی این اثر استقبال مینمایم.
مترجم
فهرست مطالب
عنوان ---------------------------------------------- صفحه
فصل اول: اکولوژی میکروبی: مقدمه و چشمانداز ۱
۱-۲-۱- منشاء اکولوژی میکروبی- ۳
۱-۵-۳- پیشرفت زیستشناسی سلولی- ۱۴
۱-۵-۴- تکامل مسیرهای متابولیسمی- ۱۶
۱-۶- ویژگیهای حیات میکروبی- ۱۷
۱-۶-۱- ساختار و تکامل شکل سلول- ۱۷
۱-۶-۲- متابولیسم و استفاده از انرژی- ۲۱
۱-۶-۴- سازگاریها و پاسخ به تحریکات- ۲۳
۱-۷- طبقهبندی و ردهبندی: مفهوم گونه- ۲۵
۱-۹- ارتباط اکولوژی میکروبی با اکولوژی عمومی- ۲۸
۱-۱۰- تغییر چهره اکولوژی میکروبی- ۳۱
۱-۱۰-۲- تنوع: از کشت تا تبارزایی مولکولی- ۳۲
۱-۱۲- تعمق بیشتر: سئوالات قابل تفکر و نقد- ۳۴
فصل دوم: تنوع میکروارگانیسمها ۳۹
۲-۲- حضور همه جایی میکروارگانیسمها ۴۰
۲-۳- تنوع شگفتانگیز ریختشناسی- ۴۱
۲-۳-۲- آنچه که در یک نام وجود دارد: پروکاریوتها ۴۳
۲-۳-۳- آزمایشات وینوگرادسکی با کمولیتوتروفها ۴۴
۲-۴- تنوع گروههای باکتریایی- ۴۵
۲-۴-۱- افزایش تعداد شاخههای باکتریها ۴۵
۲-۴-۲- گالری پُرتره باکتریایی: فرآیندها و بازیگران- ۴۷
۲-۵- کشف آرکئا بهعنوان یک قلمرو جداگانه- ۵۲
۲-۷- تفاوتهای آرکئاها- باکتریها ۶۲
۲-۸- یوکاریوتها: تغییر تصویر تنوع تبارزادشناسی- ۶۲
۲-۱۴- تعمق بیشتر: سئوالات قابل تفکر و نقد- ۸۰
فصل سوم: پیچیدگی و سادگی سیستمهای سلولی- ۸۵
۳-۳-۱- زندگی در پایینترین سطح- ۸۸
۳-۳-۲- میکروارگانیسمهای بزرگ-- ۹۲
۳-۴- حرکت سلولی و کموتاکسی- ۹۴
۳-۶- ذخیره موادغذایی و مواد اندوختهای- ۱۰۲
۳-۸- عملکرد و متابولیسم سلول- ۱۱۴
۳-۸-۳- غشاءهای داخلی در باکتریها ۱۲۰
۳-۹- تغییرشکل انرژی و محیط- ۱۲۱
۳-۹-۴- واکنش باکتریورودپسین- ۱۳۰
۳-۱۰- فعالیتهای زیست الکتروشیمیایی- ۱۳۴
۳-۱۲- تعمق بیشتر: سئوالات قابل تفکر و نقد- ۱۳۸
فصل چهارم: زیستگاه میکروبی: از دیدگاه اکولوژیکی- ۱۴۳
۴-۲- زیستگاهها: مرور کلی- ۱۴۴
۴-۳-۲- زیستگاههای دریایی- ۱۵۲
۴-۴-۱- شبکههای موادغذایی میکروبی در زیستگاه خاک-- ۱۵۷
۴-۵- سنگ و زیستگاههای زیرسطحی- ۱۶۲
۴-۵-۴- ناحیه زیرسطحی عمیق- ۱۶۵
۴-۶-۱- تنوع میکروبی جوّی: گرد و غبار آفریقایی- ۱۶۶
۴-۶-۲- اسرار باقی میماند- ۱۶۸
۴-۷- اکولوژی جمعیت در سراسر زیستگاهها ۱۷۰
۴-۷-۱- رشد جمعیت و پویایی- ۱۷۱
۴-۷-۳- زیست جغرافیا در مقابل همه چیز همه جا است، محیط انتخاب میکند- ۱۷۳
۴-۹- تعمق بیشتر: سوالات مهم قابل نقد- ۱۷۶
فصل پنجم: روش مطالعات اکولوژی میکروبی- ۱۸۱
۵-۳- نمونهبرداری و ذخیره کردن نمونه- ۱۸۴
۵-۴-۲- روشهای شمارش مستقیم- ۱۸۷
۵-۴-۳- تعیین سلولهای که به طور فعال تنفس میکنند- ۱۸۹
۵-۴-۴- هیبریداسیون درجا فلورسنت-- ۱۸۹
۵-۴-۵- میکروسکوپ الکترونی- ۱۹۲
۵-۵-۳- اندازه گیری مصرف سوبسترای کربن- ۲۰۰
۵-۶- تبارزادشناسی میکروبی- ۲۰۱
۵-۷- کشت در مقابل روشهای مولکولی: مقایسههای نمونههای خاک-- ۲۰۴
۵-۸- روشهای انگشت نگاری اجتماع- ۲۰۴
۵-۸-۱- ژل الکتروفورز شیب دار تغییر ماهیّت یافته- ۲۰۴
۵-۹- متاژنومیکس: ابزار جدیدی برای پاسخ به سئوالات اکولوژی جوامع- ۲۰۶
۵-۱۱- مطالعات ایزوتوپ پایدار ۲۱۰
۵-۱۱-۱- استفاده از ایزوتوپهای پایدار: مطالعه موردی شبکه غذایی غار موویل- ۲۱۱
۵-۱۳- تعمق بیشتر: سوالات مهم قابل نقد- ۲۱۳
فصل ششم: برهمکنشهای میکروب- میکروب- ۲۱۷
۶-۳- طبقهبندی برهمکنشهای میکروبی- ۲۲۰
۶-۴-۴- همزيستي بين باكتريها و تك ياختهها ۲۳۶
۶-۵- همزيستي قارچ- باكتري- ۲۳۷
۶-۶- برهمكنشهاي پروكاريوت- پروكاريوت- ۲۳۷
۶-۶-۲- مثالهايي از انگلها و شكارگرها ۲۳۸
۶-۷- تثبيت همزيستي: ارتباط نوستوك- ژئوسیفون- ۲۴۲
۶-۱۰- تعمق بیشتر: سوالات مهم قابل نقد- ۲۴۷
فصل هفتم: برهمكنشهاي بين ميكروارگانيسمها و گياهان- ۲۵۱
۷-۳- روابط همزيستي با سيانوباكتريها ۲۵۴
۷-۴- برهمكنشها در ریزوسفر- ۲۵۷
۷-۵-۳- ارتباط مایکوریزای دیگر- ۲۶۷
۷-۶- باکتریهای تثبیت کننده نیتروژن و گیاهان عالی- ۲۶۸
۷-۸- باكتريهاي محرك رشد گياه ۲۷۵
۷-۷-۲- ريزو باكتريهاي محرك رشد گياه ۲۷۶
۷-۹- سطوح برگ و ميكروارگانيسمها ۲۷۸
۷-۱۰- فعالیتهای زیان آور میکروگانیسمها روی گیاهان- ۲۸۱
۷-۱۰-۲- بیمارگرهای باکتریایی- ۲۸۲
۷-۱۰-۳- فعالیتهای ریزوسفری و بیماریهای گیاهی- ۲۸۶
۷-۱۱- قارچهای محرک افزایش تحمل به گرما در گیاهان- ۲۸۷
۷-۱۲- كنترل زيستي آفات و بیمارگرها ۲۸۸
۷-۱۴- تعمق بیشتر: سئوالات قابل تفکر و نقد- ۲۹۲
فصل هشتم: برهمكنشهاي بين ميكروارگانيسمها و جانوران- ۲۹۵
۸-۳- همزيستهای اوليه و ثانويه- ۳۰۱
۸-۴- برهمكنشهاي ميكروب ـ جانور: زندگي انگلي- ۳۰۳
۸-۴-۱- مقدمه اي بر زندگي انگلي- ۳۰۳
۸-۴-۲- زندگي انگلي نماتودهاي حشرات- ۳۰۳
۸-۴-۳- اثرات آلودگيهاي چند انگلي روي شدت بیماریزایی- ۳۰۴
۸-۴-۴- درون همزیستی گسترده: ولباخیا ـ زندگي انگلي يا همیاری؟ ۳۰۵
۸-۵- برهمكنشهاي ميكروب ـ جانور: همیاری- ۳۰۶
۸-۵-۱- برهمکنشهای همیاری ميكروب ـ دستگاه گوارش جانور ۳۰۶
۸-۵-۲- مطالعه موردی: درون همزیستی باکتری- پُرتار ۳۱۰
۸-۵-۳- مطالعه موردی: سوسکهای پرورش دهنده باغچههای قارچی- ۳۱۱
۸-۵-۴- همیاریهای شپشک آردی- ۳۱۲
۸-۵-۵- باکتریهای نورزای ماهی و ماهی مرکب-- ۳۱۳
۸-۶- درسهایی از اعماق: بینشهای تکاملی و اکوسیستم همزیستی در دریچههای اعماق دریا ۳۱۴
۸-۷- برهمکنش میکروب- مهره دار ۳۱۸
۸-۷-۱- باکتریها و پرندگان- ۳۲۲
۸-۷-۲- میکروارگانیسمها و انسان- ۳۲۳
۸-۸- تغذیه از میکروبها و شکار توسط جانوران- ۳۲۴
۸-۱۰- تعمق بیشتر: سئوالات قابل تفکر و نقد- ۳۲۹
فصل نهم: زندگی دسته جمعی: جوامع میکروبی- ۳۳۵
۹-۲-۱- موضوعات و سئوالات غالب در اکولوژی اجتماع میکروبی- ۳۳۸
۹-۳- متاژنومیکس: ابزار جدید برای پاسخ به سئوالاتی در مورد اکولوژی اجتماع- ۳۳۸
۹-۴- لجن زیستی و بیوفیلمها ۳۳۹
۹-۴-۱- تغییرات ساختار اجتماع طی توالی بیوفیلم- ۳۴۳
۹-۵- تشکیل جوامع سازمان یافته: حسگر حدنصاب- ۳۴۵
۹-۶- استقرار و استقرار مجدد توسط میکروارگانیسمها ۳۴۷
۹-۶-۱- مطالعه موردی: استقرار روده نوزاد استریل- ۳۴۹
۹-۶-۲- مطالعات موردی: استقرار مضّر- عوامل موثر در بیماری- ۳۴۹
۹-۶-۳- مطالعه موردی: استقرار مجدد و توالی اولیه در رسوبات بین جزر و مدی- ۳۵۰
۹-۷- پراکنش، توالی و پایداری- ۳۵۱
۹-۷-۲- رقابت بهعنوان نیروی سازماندهنده در توالی- ۳۵۲
۹-۷-۳- پايداري در مطالعات ميكروكاسم- ۳۵۴
۹-۸-۲- روابط بين ارگانيسم پُرسلولي و ميكروارگانيسمها: الگوهاي باهَمایی- ۳۵۷
۹-۹-۱- ساختار شبکههای غذایی میکروبی- ۳۶۲
۹-۹-۲- اثرات گونههای کلیدی روی شبکههای غذایی و تنوع- ۳۶۳
۹-۱۰- تولید اولیه و جریان انرژی- ۳۶۳
۹-۱۱- مثالهای جوامع میکروبی- ۳۶۷
۹-۱۱-۱- پلانکتون در اکوسیستمهای دریا ۳۶۷
۹-۱۳- تعمق بیشتر: سئوالات قابل تفکر و نقد- ۳۷۵
فصل دهم: فرآیندهای میکروبی مرتبط با چرخههای زیست ژئوشیمیایی- ۳۸۱
۱۰-۵-۲- اسمیلاسیون نیتروژن- ۳۹۴
۱۰-۵-۳- شوره گذاری (نیتراتی شدن) ۳۹۴
۱۰-۵-۴- شورهبرداری (نیتراتزدایی) ۳۹۵
۱۰-۶-۱- متابولیسم گوگرد آلی- ۳۹۷
۱۰-۶-۲- متابولیسم گوگرد معدنی- ۳۹۷
۱۰-۸-۲- فریتین و ماگنوتوزومها ۴۰۳
۱۰-۱۳- تعمق بیشتر: سئوالات قابل تفکر و نقد- ۴۱۳
فصل یازدهم: ميكروبها در حال فعاليت در طبيعت: معدني شدن زیستی و هوازدگی ميكروبي ----- ۴۱۷
۱۱-۲-۱- معدني شدن زيستي غيرفعال در مقابل معدني شدن زيستي فعال- ۴۲۱
۱۱-۳- ویژگیهای سلول و اتصال به فلز- ۴۲۲
۱۱-۴- جریان انرژی: اختلاط الکترونها و واکنشهای اکسیداسیون- احیاء ۴۲۴
۱۱-۵- انحلال در مقابل رسوب- ۴۲۷
۱۱-۶- تشکیل سنگهای معدن و موادمعدنی- ۴۲۸
۱۱-۶-۲- بازيافت مواد نفتي- ۴۲۹
۱۱-۶-۳- غارزایی حاصل از اسيد سولفوريک-- ۴۳۴
۱۱-۷- مشارکت ميکروارگانيسمها در فرآیند سيليسي شدن- ۴۳۵
۱۱-۷-۱- تشکيل سيليس در دياتومهها، شعائیان و اسفنجها ۴۳۵
۱۱-۸- معدنی شدن زیستی رسوبات آهن منگنز- ۴۳۸
۱۱-۹- میکروبیالیتهای کربنات میکروبی- ۴۴۳
۱۱-۱۰-۲- تراورتن و پوک سنگ-- ۴۴۷
۱۱-۱۰-۳- توت سنگداران و روزنداران: معدنی شدن زیستی کنترل شده ۴۴۹
۱۱-۱۲- تعمق بیشتر: سئوالات قابل تفکر و نقد- ۴۵۱
فصل دوازدهم: تجزیه ترکیبات طبیعی- ۴۵۵
۱۲-۴- تجزیه ساختارهای دیواره سلول گیاه ۴۶۱
۱۲-۴-۱- فعالیتهای پروتوپکتیناز و پکتیناز ۴۶۳
۱۲-۴-۲- تجزیه میکروبی لیگنین- ۴۶۳
۱۲-۴-۴- تجزیه آنزیمی سلولز- ۴۶۵
۱۲-۷- تجزیه زیست پلیمرهای مختلف شامل پروتئینهای رشتهای (فیبری) جانوری- ۴۶۹
۱۲-۸- اکولوژی غذاهای تخمیری- ۴۷۳
۱۲-۹- اکولوژی تولید انرژی زیستی- ۴۷۵
۱۲-۹-۴- تولید زیست دیزل توسط جلبک-- ۴۸۳
۱۲-۱۱- کمپوست کردن مواد آلی گیاهی- ۴۸۶
۱۲-۱۲- اثر تجزیه میکروبی روی انسانها ۴۸۹
۱۲-۱۴- تعمق بیشتر: سئوالات قابل تفکر و نقد- ۴۹۲
فصل سیزدهم: میکروبها در عمل: زیستپالایی- ۴۹۷
۱۳-۳- زیستپالایی بهعنوان یک فناوری- ۴۹۹
۱۳-۵- طراحی و اجرا زیستپالایی- ۵۰۲
۱۳-۵-۳- سدهای واکنشگر نفوذپذیر ۵۰۳
۱۳-۵-۴- بهینهسازی زیستپالایی- ۵۰۴
۱۳-۶- زیستپالایی ترکیبات آلی- ۵۰۶
۱۳-۷-۳- هیدروکربنهای سوخت-- ۵۱۰
۱۳-۷-۴- هیدروکربنهای پلیآروماتیک-- ۵۱۶
۱۳-۸-۱- سمیّتزدایی ترکیبات آلی کلردار ۵۲۰
۱۳-۸-۲- علفکشها و آفتکشها ۵۲۱
۱۳-۸-۳- تجزیه زیستی مواد منفجره ۵۲۳
۱۳-۸-۴- تجزیه رنگهای منسوجات- ۵۲۴
۱۳-۹- زیستپالایی آلایندههای معدنی- ۵۲۷
۱۳-۹-۱- برهمکنشهای فلز سمّی– میکروب- ۵۲۷
۱۳-۹-۲- سمیّت زدایی سلنیوم- ۵۳۴
۱۳-۹-۳- واکنشها با آرسنیک-- ۵۳۶
۱۳-۹-۴- زیستپالایی مکانهای آلوده به پرکلرات- ۵۳۸
۱۳-۹-۵- زیستپالایی آلودگی نیترات- ۵۳۹
۱۳-۱۱- تعمق بیشتر: سئوالات قابل تفکر و نقد- ۵۴۸
دسته بندی موضوعی | موضوع فرعی |
كشاورزي و منابع طبیعی |
محیط زیست
زیست شناسی |